Ein Schwerpunkt der musikalischen Ausbildung der Schülerinnen und Schüler an der SJMKS ist das gemeinsame Musizieren. Zahlreiche Orchester und Ensembles sind deshalb im Unterrichtsangebot der Schule vertreten. Diese Formationen treten auch bei vielen Gelegenheiten in den Trägerkommunen aber auch bei überregionalen und internationen Veranstaltungen auf.